草案试图统一针对欧洲大陆数据收集、储存和交流的隐私规则。
2016中国大学校友捐赠排行榜20强高校校友捐赠你追我赶,卢志强豪捐7亿夺2015中国好校友 校友捐赠是欧美世界一流大学的重要工作,是哈佛耶鲁等世界一流大学彰显其教育教学质量的核心指标,已成为评价世界一流大学的核心标准之一。持续27年从事中国大学评价研究,完全采用第三方权威机构公开透明的数据 艾瑞深中国校友会网大学研究团队组建于1989年,是目前中国持续开展大学评价研究时间最长的研究团队,至今已有27年历史,以艾瑞深中国校友会网(cuaa.net)为网络平台,重点开展中国大学评价、创业创富研究和高校发展战略咨询等工作。
报告显示,1980年至今,全国高校累计接收国内外社会捐赠(含软件捐赠)总额高达750多亿,当中校友捐赠总额为171亿,约占捐赠总额的31%。武汉大学校友捐赠增至12.31亿,稳居第3。北大清华武大复旦校友累计捐赠超10亿,跻身中国大学校友捐赠十亿俱乐部,堪称中国校友捐赠最慷慨的大学、中国最受毕业生校友认可大学。2016-01-04 06:00 · angus 2015年12月30日,艾瑞深中国校友会网正式发布《2016中国大学评价研究报告》,报告最新公布了2016中国大学排行榜100强、2016中国一流大学排行榜、2016中国大学社会捐赠排行榜和2016中国大学校友捐赠排行榜等榜单。《方案》提出,到2020年,若干所大学和一批学科进入世界一流行列,若干学科进入世界一流学科前列。
名列2016中国大学排行榜前二十的其他大学依次是吉林大学、中国科学技术大学、华中科技大学、四川大学、北京师范大学、南开大学、西安交通大学、中南大学、同济大学和天津大学等高校。其中,清华大学、北京大学和汕头大学问鼎2016中国大学社会捐赠排行榜前三强。Florea教授报告称,她和她的同事们决定开发适用于RNA-Seq数据的计算机系统,我们决定开发其他程序无法达到的算法来确定二次变异。
但RNA-Seq仍然很难准确拼凑长异构体所产生的小片段。然而这种比较是一个艰巨的任务,为了保持比较的精度,研究人员依赖于内部软件套件SpliceBox,该研究小组发现,超过60%的发现是新的,包括新的外显子、新的内含子等。霍普金斯大学医学院遗传医学研究所Liliana Florea教授表示,人类基因组计划10年前创建了剪接变异初始图谱,但该图谱仍不完整,仍欠缺包含所有可变剪接的存储库。该研究团队曾利用Illumina公司的Body Map dataset建立每个组织的可变剪接的综合目录,该目录囊括了16个组织的25亿个序列,被用于不同组织的比较。
消除毒性转录组(Toxic Transcripts)InDA-C技术效应图创建高特性的RNA-Seq文库仍面临着长期的挑战,NuGEN Technologies技术总监 Luke Sherlin博士说,减少不必要转录组如rRNA、球蛋白以及其他管家类的转录组,同时保持总RNA群中的必要转录组十分有必要。这种方法可对现有的变异注释数据库进行补充,还可为可变剪辑的进化和发展提供新的见解, Florea教授强调,但更多的RNA-Seq分析需要进一步评估,我们希望更多的实际应用,包括临床测序、基本分子生物学、癌症研究、甚至包括植物基因组学。
根据这些图像,每个细胞被识别为特定的类型(肿瘤、基质等),最终同种类型的细胞纯度在100%。Sachidanadam博士承认,准确编目线粒体DNA多样性是一项挑战,虽然线粒体DNA丰度不及总DNA的1%,但它在细胞之间多重复合,同时核DNA测序结果经常被线粒体DNA混淆。新技术可将几十到几百个纯细胞从细胞池中分离出来并用于全基因组分析。Sachidanadam博士补充说,他们利用Illumina公司的Miseq测序平台来展开这个试验,并计算假基因的含量。
Tanzi博士说,FFPE样本最初先被转化为细胞悬浊液,并被给予适当的标记,之后置于一次性的微流控盒中,一旦处于流动细胞状态,每个细胞先被CMOS芯片控制电极捕获,然后被显微镜扫描并获得荧光图像。线粒体DNA测序异质性混合物从母亲遗传给后代线粒体,这些神奇的细胞体,不仅产生ATP供应能量,还与人体罹患癌症、心脏病和糖尿病的风险有关。同时需要协议来保证文库的质量。日前,牛津大学举办的NGS七周年大会聚焦了NGS面临的挑战,这次会议阐述了NGS领域最令人生畏的障碍,同时也阐述了跨越这些障碍的技术。
相关阅读:The Next Next Thing in Sequencing。InDA-C是一种灵活的方法,容易应用于各种不同的物种如人类、小鼠、大鼠、果蝇和拟南芥等,Sherlin说,InDA-C技术是一种相对较新的方法,可提供一种独特的方式来构造任何物种的无偏差的RNA-Seq文库,且定制步骤方便简单。
本次会议中提及的NGS的新突破点包括毒性、RNA-Seq文库及可变剪接图谱中的多余转录组的去除以及线粒体DNA测序。根据NEBNext开发组组长Eileen Dimalanta博士,新的试剂能使客户克服了文库制备面临的挑战,如复杂的样品类型,FFPEDNA、样本中CG含量的统一以及PCR循环数等。
每个剪接变异体的编目带来的挑战是令人畏惧的,但RNA-Seq技术可深入分析细胞和组织的转录组,提供一种可详细描述可变剪接的技术手段。提高文库制备的性能文库制备是NGS的重要部分,成功的测序需要高质量的文库来产生足够的收益。Sachidanadam博士说,将线粒体孤立起来相当苦难,我们的方法包括通过耗尽线性核DNA及廉价测序来净化线粒体DNA,MSeek可产生高纯度的线粒体DNA(90%),所达的灵敏度和特异性前所未有,这个方法是净化和检测线粒体DNA的新方法。细胞池中可能包括上皮-间充质转化细胞、肿瘤浸润淋巴细胞和间质细胞。显然,研究人员在NGS领域取得了令人兴奋的进展,未来应该有更快、更精确、更新颖的技术。使用MSeek技术,该研究团队得到了一个惊人的发现,我们不仅证实了异质性无处不在(多个线粒体DNA单倍体的存在),我们还发现了异质性可作为细胞类型的识别指纹,此外我们还发现细胞之间可互相交换线粒体DNA,这影响了单个细胞中线粒体DNA的稳定性。
高性能的分析是十分必要的,包括低输入量以及低质量样本或包含极端CG含量样本的分析。该技术的另一个可能用途是进行非常小的样本的遗传分析,包括细针穿刺标本和肿瘤低细胞结构的遗传分析。
GEN:展望NGS的下一个突破点,RNA-Seq和线粒体测序上榜 2016-01-06 06:00 · 280144 近年来,尽管NGS取得了诸多进步,但依然存在一些重大的挑战日前,牛津大学举办的NGS七周年大会聚焦了NGS面临的挑战,此次会议阐述了NGS领域最令人生畏的障碍,同时也阐述了跨越这些障碍的技术。
西奈山医院肿瘤学教授Ravi Sachidanadam博士引领的研究证实了这些观点。Sachidanadam博士说,我们团队现研究成果仅仅是MSeek技术所揭露的一小部分,虽然MSeek技术目前面临的局限为所需的DNA总量至少为4ug,我们预计该技术将被应用到其他领域中,不仅包括治疗,还包括取证等。
消除毒性转录组(Toxic Transcripts)InDA-C技术效应图创建高特性的RNA-Seq文库仍面临着长期的挑战,NuGEN Technologies技术总监 Luke Sherlin博士说,减少不必要转录组如rRNA、球蛋白以及其他管家类的转录组,同时保持总RNA群中的必要转录组十分有必要。可变剪接和RNA-Seq数据库RNA-Seq技术还提供了一个宝贵的工具来破译转录组的可变剪接。同时需要协议来保证文库的质量。由于测序技术的提高以及范围的扩大都受文库建设的推动。
Sachidanadam教授表示,真核细胞有两个基因组——核DNA(nDNA)和线粒体DNA(mtDNA),虽然线粒体的活性取决于上千个蛋白质,这些蛋白主要由核DNA编码,但由线粒体DNA编码的蛋白(大约13个以上)也扮演了关键的角色。但RNA-Seq仍然很难准确拼凑长异构体所产生的小片段。
然而这种比较是一个艰巨的任务,为了保持比较的精度,研究人员依赖于内部软件套件SpliceBox,该研究小组发现,超过60%的发现是新的,包括新的外显子、新的内含子等。GEN:展望NGS的下一个突破点,RNA-Seq和线粒体测序上榜 2016-01-06 06:00 · 280144 近年来,尽管NGS取得了诸多进步,但依然存在一些重大的挑战。
显然,研究人员在NGS领域取得了令人兴奋的进展,未来应该有更快、更精确、更新颖的技术。NGS的另一个突破点为肿瘤异质性分析,长期以来肿瘤分析都被异质性困扰着,但幸运的是,异质性肿瘤样本可通过排序程序将病变细胞从总群体中分离出来,且这些细胞群更适合测序。
这种方法可对现有的变异注释数据库进行补充,还可为可变剪辑的进化和发展提供新的见解, Florea教授强调,但更多的RNA-Seq分析需要进一步评估,我们希望更多的实际应用,包括临床测序、基本分子生物学、癌症研究、甚至包括植物基因组学。Florea教授报告称,她和她的同事们决定开发适用于RNA-Seq数据的计算机系统,我们决定开发其他程序无法达到的算法来确定二次变异。新技术可将几十到几百个纯细胞从细胞池中分离出来并用于全基因组分析。Sachidanadam博士补充说,他们利用Illumina公司的Miseq测序平台来展开这个试验,并计算假基因的含量。
线粒体DNA测序不是一件小事,因为每个线粒体携带了多个线粒体基因组(5-10个),且每个细胞拥有成百上千的线粒体。从FFPE中分离出纯的肿瘤细胞根据Silicon Biosystems首席商务官Raimo Tanzi博士,肿瘤分析通常因为异质性而存在困扰,数字分析方法的引进,如NGS和数字PCR可助于梳理少数的肿瘤样本,然而只有均质抽样才能提供最清晰的解释。
使用这种工具,她希望能够明确可变剪接是如何发生以及如何随细胞类型发生变化。线粒体DNA测序异质性混合物从母亲遗传给后代线粒体,这些神奇的细胞体,不仅产生ATP供应能量,还与人体罹患癌症、心脏病和糖尿病的风险有关。
NuGEN Technologies公司开发了新技术来实现这个目标,他们在RNA-Seq文库构建的过程中,利用InDA-C(Insert-Dependent Adaptor Cleavage )方法(使用特定的酶)来消除文库中多余的转录组序列,这种方法与杂交捕获方法形成对比。根据这些图像,每个细胞被识别为特定的类型(肿瘤、基质等),最终同种类型的细胞纯度在100%。
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